卢本卓 研究员（中国科学院数学与系统科学研究院）

从离子通道的模拟谈谈计算的问题

3月20日（周四）下午16：00-17：00，蓝白楼311

离子通道在生物里起到导电、导流的广泛作用。作为例子，先介绍我们目前打算关心的两个相关课题，一个是电磁场照射离子通道后的生物响应（多尺度特点），一个是糖分子的纳米孔测序设想（计算量大）。然后介绍一下传统的数值方法模拟离子通道电流要处理的一些环节：物理模型、分子几何和网格、计算求解（分子动力学、有限元）。对计算来说在任何环节的细节上都可产生大量丰富的计算课题研究，比如网格生成、贴体和非贴体的有限元方法等。尽管现在我们可以实现单点的有限元计算，但对于类似前面介绍的课题目标来说，模拟方法研发和实行的效率都太慢或者代价太大。我觉得，对应用来说，计算当以最终目标作为评测指标（误差函数），那么，可思考一些有效的处理方案，如，降维降阶处理（发现主要特征尺度），计算过程的整合和计算目标的集中等，接着最后也可和大家一起自由思考从工业时代到智能时代 计算模拟可能的演化。